Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Q10P01898 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms