Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01811 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01811 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01811 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01811 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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