Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01787 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01787 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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P01787 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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P01787 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01787 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01787 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01787 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01787 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01787 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01787 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01787 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01787 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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