Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Hcn1O88704 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hcn1O88704 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Hcn1O88704 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hcn1O88704 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcn1O88704 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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