Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sap30O88574 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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