Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SlkO54988 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SlkO54988 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SlkO54988 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms