Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FxnO35943 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FxnO35943 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FxnO35943 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FxnO35943 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FxnO35943 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FxnO35943 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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FxnO35943 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FxnO35943 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FxnO35943 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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FxnO35943 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FxnO35943 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FxnO35943 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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