Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
TnxbO35452 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms