Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casq1O09165 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms