Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm6871L7N248 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm6871L7N248 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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