Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm21310J3QQ23 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
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