Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Gm21887J3QQ04 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm21887J3QQ04 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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