Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5294J3QP53 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms