Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Zfp616J3QN14 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms