Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28051J3QMA2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28051J3QMA2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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