Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20825J3QM67 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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