Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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