Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm17535J3KMR8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms