Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Cldn20G5E8X0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn20G5E8X0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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