Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Farp1F8VPU2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Farp1F8VPU2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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