Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms