Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms