Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SmgcF6VRN1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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