Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms