Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm340F6RGI3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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