Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmod3E9QA62 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmod3E9QA62 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms