Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Urb2E9Q7L1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Urb2E9Q7L1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms