Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf169E9Q7F2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf169E9Q7F2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms