Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms