Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20425E9Q035 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms