Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms