Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Syde2E9PUP1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms