Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmf1B9EKI3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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