Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp26c1B2RXA7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp26c1B2RXA7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms