Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usf3B2RUQ2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usf3B2RUQ2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms