Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms