Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Apba1B2RUJ5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Apba1B2RUJ5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms