Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Prrt4B2RU40 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Prrt4B2RU40 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms