Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ssxb8B1AY40 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssxb8B1AY40 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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