Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spocd1B1ASB6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms