Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmem238A9JSM3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms