Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Samt1A2BED8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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