Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rtf1A2AQ19 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Rtf1A2AQ19 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtf1A2AQ19 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms