Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms