Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms