Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Frmpd4A2AFR3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms