Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer3W4VSP1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Speer3W4VSP1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Speer3W4VSP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Speer3W4VSP1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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