Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28036V9GXJ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28036V9GXJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28036V9GXJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms