Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdfS4R2K0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdfS4R2K0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PdfS4R2K0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms