Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U4

Elf4, ETS-related transcription factor Elf-4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf4Q9Z2U4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elf4Q9Z2U4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elf4Q9Z2U4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elf4Q9Z2U4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elf4Q9Z2U4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms